Фев 152014
 

На удивление, обновление встало по инструкции http://doc.owncloud.org/server/6.0/admin_manual/maintenance/update.html

  1. Make a backup of the ownCloud folder and the database.
  2. Make sure that updater plugin is enabled.
  3. Navigate to the ‘Admin’ page.
  4. Click ‘Update’.
  5. Refresh the page with Ctrl+F5.

И в админке теперь номер версии ownCloud 6.0.1 (stable), а вот в строке наверху по прежнему светится  жёлтым сообщение о новой версии. Рестарт apache, logout и ctrl+F5 не помогли. Ладно, потом посмотрю.